Pubblicazioni

- BMB: Bibliografia dei manoscritti in scrittura beneventana, (cum aliis): Viella, Roma, III-V, 1995-1997.
-S. Zamponi, M. Pantarotto, A. Tomiello, Stratigrafia dello Zibaldone e della Miscellanea Laurenziani, in Gli Zibaldoni del Boccaccio. Memoria, scrittura e riscrittura, Atti del Seminario internazionale di Firenze - Certaldo (26-28 aprile 1996), a cura di M. Picone e C. Cazalé Bérard, Firenze, Franco Casati, 1998, 181-258
- I manoscritti medievali della Provincia di Prato, (cum aliis), Regione Toscana - Sismel, Firenze, Edizioni del Galluzzo, 1999
-S. Boynton - M. Pantarotto, Ricerche sul Breviario di Santa Giulia (Brescia, Biblioteca Queriniana, ms. H VI 21), «Studi Medievali» 42/1 (2001), 301-318
- La Biblioteca manoscritta del Convento di San Francesco Grande di Padova, Padova, Centro Studi Antoniani, 2003.
- Un terzo testimone del libellus de sancto Philastrio: il Passionario della Biblioteca Comunale di Trento 1566, «Annali Queriniani» 4 (2003), 95-113
- CODEX: Inventario dei manoscritti medievali della Toscana, Regione Toscana - S.I.S.M.E.L., direzione dei lavori C. Leonardi - S. Zamponi, a cura di G. Pomaro, Data bese di circa 3000 manoscritti e 2000 record bibliografici, codex@sismelfirenze.it oppure www.cultura.toscana.it
- Recensione a I manoscritti datati di Padova, «Il Santo», 44 (2004), 579-586.
- Nuovi manoscritti appartenuti al Convento osservante di San Francesco grande di Padova, «Il Santo», 45 (2005), 723-736
- La scrittura dei notai bresciani nel corso del secolo XII, «Scrineum. Saggi e materiali on line di scienza del documento medievale», 3 (2005): www.scrineum.unipv.it
- Ancora sulla biblioteca manoscritta del Convento di S. Francesco Grande di Padova: riflessioni e spunti di ricerca, «Il Santo» 46 (2006), 437-450
- La (ri)costruzione di un manoscritto: nello scriptorium di Bobbio al tempo dell’abate Agilulfo (887-896), intervento tenuto al Convegno Manuscript Books in the Early Middle Ages (saec. VI-XI), Roma, 30 May-3 June 2004, «Scriptorium» 61 (2007), 48-73.
- I manoscritti medievali di Vicenza e provincia, a cura di N. Giovè, L. Granata e M. Pantarotto, con la collaborazione di G. Mariani Canova e F. Toniolo, SISMEL – Edizioni del Galluzzo, 2007
- Recensione a R. Quinto, Manoscritti medievali nella Biblioteca dei Redentoristi di Venezia (S. Maria della consolazione, detta “della Fava”), Padova, Il Poligrafo, 2006, «Il Santo» 47 (2007), 372-376.
- Recensione a Il dono di Malatesta Novello, a cura di Loretta Righetti e Daniela Savoia, Atti del Convegno, Cesena, 21-23 marzo 2003, Cesena, Società Editrice “Il Ponte Vecchio”, 2006, «Il Santo» 47 (2007), 367-371
- I manoscritti datati delle province di Frosinone, Rieti e Viterbo, a cura di L. Buono, Marco Palma, Eugenia Russo, con il contributo di M. Pantarotto e altri, SISMEL – Edizioni del Galluzzo, 2007
- I manoscritti datati della Biblioteca Queriniana di Brescia, a cura di M. Pantarotto e N. Giovè Marchioli, SISMEL – Edizioni del Galluzzo, 2008

- Note di lettura. Libri, biblioteche e cultura degli Ordini regolari nell’Italia moderna, «Il Santo» 48 (2008), 483-497

- Frammenti di un omeliario toscano in Ambrosiana, «Medioevo e Rinascimento»,  22 / n.s. 29 (2008), 461-469

- MANUS: manoscritti delle biblioteche italiane: pubblicazione online di  200 schede descrittive di manoscritti conservati nella Biblioteca Trivulziana di Milano (120 schede di mss) e nelle sedi minori di Milano e della Lombardia, principalmente francescane (cfr. http://www.manoscrittilombardia.it)

- Note di lettura al Catalogo dei codici della Biblioteca Capitolare di Padova, «Il Santo» 49 (2009), 555-571

- Manoscritti francescani dispersi e recuperati in Lombardia: prime ricerche, «Quaderni della Biblioteca del Convento francescano di Dongo» 58 (2009), 63-73