CURRICULUM DELL’ATTIVITÀ DIDATTICA E SCIENTIFICA

Prof. Carlo MISCHIATI

DATI ESSENZIALI

Laurea in Scienze Biologiche (1991)
Dottore di Ricerca in Biotecnologie (1995)
Ricercatore Universitario BIO/10, Facoltà di Farmacia, Università di Ferrara, dal 1998 al 2011

Posizione attuale: Professore Associato BIO/12, Facoltà di Medicina e Chirugia, Università di Ferrara

Il Prof. Carlo Mischiati è autore di 85 lavori scientifici pubblicati su riviste internazionali (IF totale = 240) con un IF medio = 3,43. Sono 18 i lavori nei quali è stato primo o ultimo autore (IF attivo = 63) pari al 26,2 % dell’IF totale (IF attivo medio 3,49). L'H-INDEX è 20.

Pubblicazioni scientifiche presenti in PubMed/Medline – 73
Capitoli di libro – 2.
Brevetti internazionali come inventore – 3
Revisore per riviste scientifiche – Riviste internazionali Retrovirology e Molecular Pharmacology


Brevetti per invenzione industriale

-Internazionali

n° PCT/IB2003/002632 - Anno 2003. Titolo: A novel use of rapamycin and structural analogues thereof. Inventori: Bianchi N, Borgatti M, Gambari R, MISCHIATI C.
n° PCT/IB2002/002628 - Anno 2002. Titolo: Use of heterocyclic polyamides structurally related to the natural antibiotic distamycin A for the treatment of beta-thalassaemia. Inventori: Baraldi G, Bianchi N, Feriotto G, Gambari R, MISCHIATI C, Romagnoli R.
n° PCT/EP2001/002804 - Anno 2001. Titolo: Synthetic oligonucleotides as inducers of erythroid differentiation. Inventori: Bianchi N, Feriotto G, Gambari R, MISCHIATI C.

- Nazionali

n.° 04188110154 - Anno 1993. Titolo: Apparecchiatura per l’applicazione in automazione della metodica di estrazione e purificazione dell’acido desossiribonucleico e dell’acido ribonucleico in fase solida. Inventori: Fiorentino D, MISCHIATI C, Di Biase S, Gambari R.


ATTIVITÀ DIDATTICA

Partecipazione alle commissioni d’esame

- Nominato CULTORE DELLA MATERIA in “Biochimica” dalla Facoltà di Farmacia dell’Università di Ferrara a partire dal 01-07-1996
- Partecipa alle commissioni esaminatrici per gli esami di profitto di BIOCHIMICA APPLICATA (BIO/10) e METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10) del corso di Laurea in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche a partire dall’AA 1996-97.
- Partecipa alle commissioni d’esame di profitto di LABORATORIO DI METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, DU Biotecnologie Agro-Industriali), METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, L.S. in CTF e L.M. in Biotecnologie), BIOLOGIA MOLECOLARE (BIO/11, L.S. in CTF), BIOCHIMICA (BIO/10, L.S. Farmacia), a partire dall’AA 1998-99.
- Partecipa alle commissioni d’esame di profitto del corso integrato di PRODUZIONE INDUSTRIALE, TECNICHE DI PRODUZIONE MOLECOLARE (BIO/11, L.S. in Biotecnologie Medico-Farmaceutiche) a partire dall’AA 2007-08 fino all'AA 2009/2010.
- Partecipa alle commissioni d'esame di profitto del corso integrato di BIOCHIMICA APPLICATA E PROTEINE RICOMBINANTI, modulo di PROTEINE RICOMBINANTI (BIO/11, L.M a ciclo unico in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche dall'AA 2010-2011 ad oggi.
- - Partecipa alle commissioni d'esame di profitto del corso di PROTEINE RICOMBINANTI (BIO/11, L.S. in Farmacia dall'AA 2010-2011 ad oggi.
- Partecipa alle commissioni d’esame generale di Laurea in CTF, Farmacia, Biologia e Biotecnologie dall’AA 1998-99 ad oggi.


Docenza

- Docente incaricato del Corso annuale di METODOLOGIE BIOCHIMICHE (SSD E05A, annuale, 70 ore) per il CL di Chimica e Tecnologia Farmaceutiche, Facoltà di Farmacia, Università di Ferrara, AA 1998-99, AA 1999-2000, AA 2000-01, AA 2001-02, AA 2002-03, AA 2003-04, AA 2004-05.
- Docente incaricato del Corso di LABORATORIO DI METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, 6 cfu, 90 ore) per il CL in Biotecnologie Agro-industriali, Facoltà di Scienze, Università di Ferrara, AA 2002-03.
- Docente incaricato del Corso Integrato di Biologia Molecolare e Metodologie Biochimiche, modulo di METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, 6 cfu) per il CL in Biotecnologie Farmaceutiche, Facoltà di Farmacia, Università di Ferrara, AA 2002-03.
- Docente incaricato del Corso Integrato di Tecnologie Cellulari e Biochimiche, modulo di METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, 3 cfu) e di LABORATORIO DI METODOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, 3 cfu) per il CL in Biotecnologie Interfacoltà (Medicina, Scienze, Farmacia), AA 2003-04.
- Docente incaricato del Corso Integrato di TECNOLOGIE BIOCHIMICHE (BIO/10, 6 cfu) per il CL in Biotecnologie Interfacoltà (Medicina, Scienze, Farmacia), AA 2004-05, AA 2005-06.
- Docente incaricato del Corso Integrato di PRODUZIONE INDUSTRIALE, modulo di TECNICHE DI PRODUZIONE MOLECOLARE (BIO/11), per il CL in Biotecnologie Medico-Farmaceutiche, Università di Ferrara, AA 2007-08, 2008-2009, 2009-2010.
- Docente incaricato del Corso Integrato di BIOCHIMICA APPLICATA E PROTEINE RICOMBINANTI, modulo di PROTEINE RICOMBINANTI(BIO/11, 4 cfu), per il CL in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche, Università di Ferrara, AA 2010-2011, 2011-2012.
- Docente incaricato del Corso di PROTEINE RICOMBINANTI (BIO/11, 4 cfu), per il CL in Farmacia, Università di Ferrara, AA 2010-2011, 2011-2012.


Altre attività didattiche

- Componente della Commissione Didattica di Facoltà di Farmacia, Università di Ferrara, AA 2001-2003.
- Membro del GAV della Facoltà di Farmacia per il triennio 2008/2011.
- Membro del COLLEGIO DEI DOCENTI del Dottorato di Ricerca in “Biotecnologie e Medicina Molecolare”, Università degli Studi di Modena e Reggio Emilia, AA 1999-2000.
- Membro del COLLEGIO DEI DOCENTI del Dottorato di Ricerca in “Biochimica e Biologia Molecolare”, Università di Ferrara, AA 2000-01, AA 2001-02, AA 2002-03.
- Membro del COLLEGIO DEI DOCENTI del Dottorato di Ricerca in “Biochimica, Biologia Molecolare e Biotecnologie”, Università di Ferrara, AA 2003-04 ad oggi.
- Seminari per l'aggiornamento dei tecnici dell’Università di Ferrara AA 2001-2002, dal titolo “Lo STI571: un farmaco innovativo nel bersagliare la traslocazione BCR-Abl della leucemia mieloide cronica” e “Nuove prospettive in farmacoterapia: la tecnologia dei macroarrays e dei microarrays”, all’interno del corso ECM di aggiornamento “Biotecnologie Biomediche”
- Responsabile scientifico e tutore della dottoranda dott.ssa Alessia Sereni, dottorato di Ricerca in Biochimica e Biologia Molecolare - XVII° Ciclo, titolo della tesi: “Analisi dell’espressione di geni marcatori della progressione tumorale e del differenziamento eritroide”
- Relatore di decine di tesi di Laurea sperimentale per i corsi di Laurea in CTF e Scienze Biologiche.


ATTIVITÀ SCIENTIFICA


Carriera Scientifica

1991-95 Dottorando in Biotecnologie, studi sul progetto di ricerca per il conseguimento del dottorato “Interazione di proteine nucleari con regioni del genoma di HIV-1 omologhe ad elementi regolativi del promotore dei geni MHC di classe II” svoltosi presso il Dipartimento di Biochimica a Biologia Molecolare, Università di Ferrara

1995-97 Borsista dell’Istituto Superiore di Sanità - Progetto AIDS – durata biennale - Progetto di Ricerca “Studio dei meccanismi molecolari utilizzati dalla proteina Tat di HIV-1 nel controllo della sopravvivenza e della proliferazione cellulare” svoltosi presso il Laboratorio di Biologia Cellulare dell'Istituto di Anatomia Umana Normale dell'Università di Ferrara.

1997-98 Borsista AIRC – durata annuale - Progetto di Ricerca "Struttura di geni tumore-associati: espressione genica e sua modulazione bio-farmacologica" svoltosi presso il Dipartimento di Biochimica a Biologia Molecolare dell'Università di Ferrara.

1998-2011 - Ricercatore Universitario (BIO/10), presso il Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Sezione di Biologia Molecolare, Università di Ferrara

2011 ad oggi - Professore Associato (BIO/12), Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Sezione di Biochimica e Biochimica Clinica, Università di Ferrara


Partecipazione a Progetti di Ricerca

Il Prof. Mischiati ha fatto parte di Unità Operative inserite in Progetti di Ricerca elencati qui di seguito (elenco parziale):

- Progetto ISS/AIDS – anni 1990-1992 – tema della ricerca: Identificazione e caratterizzazione di proteine eucariotiche che legano oligosequenze di HIV;
- Progetto Finalizzato C.N.R. Ingegneria Genetica – anni 1992-1995 – tema della ricerca: Clonaggio di sequenze codificanti per proteine coinvolte nella regolazione dell'espressione dei geni HLA-D;
- Progetto Regione Emilia Romagna - tema della ricerca: Studio in vitro e in vivo di potenziali farmaci antineoplastici: veicolazione selettiva con liposomi coniugati ad anticorpi monoclonali;
- Progetto AIRC, Associazione Italiana Ricerca sul Cancro – anni 1991-1992 – tema della ricerca: Caratterizzazione e clonaggio di proteine nucleari che riconoscono sequenze segnale presenti nella regione 5' di oncogeni cellulari;
- Progetto di ricerca con le Industrie Menarini Ricerche e Bristol-Myers Squibb – tema della ricerca: Sviluppo di metodologie biomolecolari per lo studio di farmaci ad attività antitumorale e antivirale;
- Progetto di collaborazione scientifica con la Ditta Beckman Analytical – tema della ricerca: Sviluppo di kit diagnostici per infezioni virali e patologie molecolari;
- Progetto Telethon, – tema della ricerca: Pharmacological and genetic modulation of globin gene expression in human cells;
- Progetto Finalizzato CNR ACRO, Applicazioni Cliniche della Ricerca Oncologica – anni 1992-1995 – tema della ricerca: Proteine di regolazione dell'espressione di oncogeni cellulari: identificazione, caratterizzazione e clonaggio;
- Progetto Fondazione Italiana per la Guarigione dalla Thalassemia – tema della ricerca: Modulation of globin gene expression in human cells;
- Progetto AIRC – anni 1992-1994 – tema della ricerca: Caratterizzazione e clonaggio di proteine nucleari che riconoscono sequenze presenti nella regione 5' di oncogeni cellulari;
- Progetto AIRC – anni 1995-1996 – tema della ricerca: Struttura di geni tumore-associati: Espressione genica e sua modulazione bio-farmacologica;
- Progetto Ministero della Sanità – anni 1996-1997 – tema della ricerca: Fully automated genetic diagnosis of cystic fibrosis;
Progetto CNR PF Biotecnologie – anni 1998-1999 – tema della ricerca: Affinità di oligonucleotidi e PNA formanti tripla elica per promotori eucariotici e virali: effetti biologici e potenziale sinergismo d’azione con DNA-binding drugs;
- Progetto Programma Nazionale di ricerca sull’AIDS – anni 1997-1998 – tema della ricerca: Alterazione dell’espressione genica di HIV-1 con DNA-binding drugs e oligonucleotidi sintetici;
Progetto MURST-PRIN – anni 1998-2001 – tema della ricerca: Uso di PNA, ribozimi e peptidi per lo studio di funzioni geniche e possibile applicazioni diagnostiche e terapeutiche;
- Progetto Ministero della Sanità, Programma per la ricerca finalizzata – anno 1998 – tema della ricerca: Ruolo dell’espressione di geni per fattori di trascrizione nel controllo dei geni HLA-A, -B, -C in cellule normali e neoplastiche.


Progetti di Ricerca di cui è stato responsabile scientifico

- Fondo di Ateneo per la Ricerca (FAR) Università di Ferrara – anno 2007 – tema della ricerca: Studio dei meccanismi trascrizionali coinvolti nella regolazione dell’espressione del gene umano SCN5A responsabile della morte improvvisa per arresto cardiaco;
- FAR Università di Ferrara – anno 2008 – tema della ricerca: Caratterizzazione biochimica e funzionale di un nuovo promotore del gene umano SCN5A;
- Progetto Fondazione CARIFE – anno 2008 – tema della ricerca: Studio della regolazione dell’espressione del gene SCN5A umano responsabile di patologie cardiache aritmiche letali al fine di ampliare le possibilità di diagnosi precoce.


Pubblicazioni su riviste nazionali (elenco parziale)

- Piva R, Barbieri R, MISCHIATI C, Feriotto G, Nastruzzi C, Volinia S, Gambari R. Structure and methylation state of the human transferrin receptor gene: preliminary analysis on tumor cell lines, primary tumors and some normal tissues. Boll Soc Ital Biol Sper. 63, pagg. 311-315, 1987.
- MISCHIATI C, Barbieri R, Nastruzzi C, Orlando P, Gambari R. "In vitro" methylation of GCGC sites of the human HLA-DR alpha gene by E. coli HhaI methylase: effects of chromatin proteins. Boll Soc Ital Biol Sper. 64, pagg. 489-493, 1988.
- Barbieri R, Gambari R, Buzzoni D, Piva R, Orlando P, MISCHIATI C, del Senno L, Nastruzzi C, Giacomini P, Natali PG. Methylation state of cellular genes and oncogenes as a marker of malignancy in human carcinomas. Tumori 75, pagg. 321-328, 1989.
- Feriotto G, Volinia S, MISCHIATI C, Nastruzzi C, Scapoli C, Barrai I, Gambari R. Interazione tra proteine cellulari e regioni del genoma di HIV-1 selezionate con tecnologie bioinformatiche. In: Oligonucleotidi sintetici nello studio della biologia molecolare di HIV-1, Gambari e Nastruzzi editori, Ferrara, pagg. 19-22, 1991.
- MISCHIATI C, Feriotto G, Fiorentino D, Gambari R. La robotica in biologia molecolare: isolamento di DNA genomico da cellule in coltura. In: Oligonucleotidi sintetici in diagnostica molecolare, Gambari e Nastruzzi editori, Ferrara, pagg. 119-125, 1992.
- MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. A new automated method for isolation of genomic DNA from eukaryotic cells. Boll Soc Ital Biol Sper 69, pagg. 7-11, 1993.
- MISCHIATI C, Bianchi N, Nastruzzi C, Di Biase S, Fiorentino D, Feriotto G, Gambari R. Novel methods in biotechnology: biorobotics systems for the isolation of DNA and capillary electrophoresis for PCR products analysis. Minerva Biotecnologica 5, pagg. 166-173, 1993. ISSN 1120-4826
- Gambari R, Volinia S, Feriotto G, Nesti C, MISCHIATI C, Scapoli C, Barrai I. Computer-assisted production of sets of frequent DNA decamers enriched of transcription control signals. Minerva Biotecnologica 5, pagg. 193-198, 1993. ISSN 1120-4826
- Feriotto G, Nastruzzi C, MISCHIATI C, Gambari R. Synthetic oligonucleotides mimicking genomic regulatory regions: evaluation of the effects of DNA-binding drugs on the interaction between transcriptional factors and target DNA sequences. Minerva Biotecnologica 5, pagg. 224-232, 1993. ISSN 1120-4826
- Feriotto G, MISCHIATI C, Bianchi N, Rutigliano C, Giacomini P, Gambari R. Transcription factors motifs of the human HLA-DRA gene. Minerva Biotecnologica 7, pagg. 111-115, 1995. ISSN 1120-4826
- Passadore M, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C, Giacomini P, Piva R, Gambari R. PCR analysis of the sequence-selectivity of distamycin and two distamycin analogues. Minerva Biotecnologica 7, pagg. 182-187, 1995. ISSN 1120-4826
- MISCHIATI C, Feriotto G, Bianchi N, Gambari R. Use of the A.L.F. DNA sequencing system for DNAase I footprinting studies. Minerva Biotecnologica 7, pagg. 15-19, 1995. ISSN 1120-4826
- Bianchi N, Passadore M, Feriotto G, MISCHIATI C, Piva R, Gambari R. Novel methods to investigate sequence-selectivity of DNA-drugs interactions. Minerva Biotecnologica 7, pagg. 29-33, 1995. ISSN 1120-4826
- Passadore M, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C, Rutigliano C, Gambari R. Sequence-specific inhibition of polymerase-chain reaction by the antitumor compound U-71184. Minerva Biotecnologica 8, pagg. 191-194, 1996. ISSN 1120-4826
- Rutigliano C, Bianchi N, Passadore M, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. Effects of triplex-forming oligonuleotides and DNA-binding drugs on protein/DNA interactions. Minerva Biotecnologica 8, pagg. 179-182, 1996. ISSN 1120-4826
- MISCHIATI C, Rutigliano C, Feriotto G, Borgatti M, Bianchi N, Gambari R. Effects of peptide nucleic acids (PNAs) on gene transcription. In: “Applications of peptide nucleic acids (PNA) in molecular medicine and biotechnology”. Minerva Biotecnologica 11, pagg. 205-209, 1999. ISSN 1120-4826
- MISCHIATI C, Sereni A, Gambari R. Use of macroarray technology to study the effects of DNA-binding drugs on gene expression profile of erythroid-induced human leukemic K562 cells. In: “Trends in molecular diagnosis and therapy of beta-thalassemia and sickle cell anemia”. Minerva Biotecnologica 15, pagg. 153-160, 2003. ISSN 1120-4826,


Pubblicazioni internazionali

- MISCHIATI C, Melloni E, Corallini F, Milani D, Bergamini C, Vaccarezza M. Potential role of PKC inhibitors in the treatment of hematological malignancies. Curr Pharm Des. 2008;14(21):2075-84, PMID 18691117 [PubMed - indexed for MEDLINE], ISSN 1381-6128. (IF2007: 4.868)
- Barbarotto E, Corallini F, Rimondi E, Fadda R, MISCHIATI C, Grill V, Vaccarezza M, Celeghini C. Differential effects of chemotherapeutic drugs versus the MDM-2 antagonist nutlin-3 on cell cycle progression and induction of apoptosis in SKW6.4 lymphoblastoid B-cells. J Cell Biochem. 2008 May 15;104(2):595-605, ISSN 0730-2312. (IF2007: 3.381)
- Fibach E, Bianchi N, Borgatti M, Zuccato C, Finotti A, Lampronti I, Prus E, MISCHIATI C, Gambari R. Effects of rapamycin on accumulation of alpha-, beta- and gamma-globin mRNAs in erythroid precursor cells from beta-thalassaemia patients. Eur J Haematol. 2006 Nov;77(5):437-41, ISSN 0902-4441. (IF2007: 2.163)
- Sibilla P, Sereni A, Aguiari G, Banzi M, Manzati E, MISCHIATI C, Trombelli L, del Senno L. Effects of a hydroxyapatite-based biomaterial on gene expression in osteoblast-like cells. J Dent Res. 2006 Apr;85(4):354-8, ISSN 0022-0345. (IF2007: 3.496)
- MISCHIATI C, Natali PG, Sereni A, Sibilio L, Giorda E, Cappellacci S, Nicotra Mr, Mariani G, Di Filippo F, Catricala C, Gambari R, Grammatico P, Giacomini P. cDNA-array profiling of melanomas and paired melanocyte cultures. J Cell Physiol. 2006 Jun;207(3):697-705, ISSN 0021-9541. (IF2007: 3.643)
- Giorda E, Sibilio L, Martayan A, Feriotto G, Bianchi N, MISCHIATI C, Di Rosa F, Pozzi L, Gambari R, Giacomini P. Modular usage of the HLA-DRA promoter in extra-hematopoietic and hematopoietic cell types of transgenic mice. FEBS J. 2005 Jun;272(12):3214-26, ISSN 1742-464X. (IF2007: 3.396)
- Bertagnolo V, Brugnoli F, MISCHIATI C, Sereni A, Bavelloni A, Carini C, Capitani S. Vav promotes differentiation of human tumoral myeloid precursors. Exp Cell Res. 2005 May 15;306(1):56-63, ISSN 0014-4827. (IF2007: 3.695)
- Borgatti M, Finotti A, Romanelli A, Saviano M, Bianchi N, Lampronti I, Lambertini E, Penolazzi L, Nastruzzi C, MISCHIATI C, Piva R, Pedone C, Gambari R. Peptide nucleic acids (PNA)-DNA chimeras targeting transcription factors as a tool to modify gene expression. Curr Drug Targets. 2004 Nov;5(8):735-44, ISSN 1389-4501. (IF2007: 4.035)
- MISCHIATI C, Sereni A, Finotti A, Breda L, Cortesi R, Nastruzzi C, Romanelli A, Saviano M, Bianchi N, Pedone C, Borgatti M, Gambari R. Complexation to cationic microspheres of double-stranded peptide nucleic acid-DNA chimeras exhibiting decoy activity. J Biomed Sci. 2004 Sep-Oct;11(5):697-704, ISSN 1021-7770. (IF2007: 2.024)
- MISCHIATI C, Sereni A, Lampronti I, Bianchi N, Borgatti M, Prus E, Fibach E, Gambari R. Rapamycin-mediated induction of gamma-globin mRNA accumulation in human eryhtroid cells. Br J Haematol. 2004 Aug;126(4):612-21, ISSN 0007-1048. (IF2007: 4.490)
- Penolazzi L, Borgatti M, Lambertini E, MISCHIATI C, Finotti A, Romanelli A, Saviano M, Pedone C, Piva R, Gambari R. Peptide nucleic acid-DNA decoy chimeras targeting NF-kappaB transcription factors: Induction of apoptosis in human primary osteoclasts. Int J Mol Med. 2004 Aug;14(2):145-52, ISSN 1107-3756. (IF2007: 1.847)
- Cortesi R, MISCHIATI C, Borgatti M, Breda L, Romanelli A, Saviano M, Pedone C, Gambari R, Nastruzzi C. Formulations for natural and peptide nucleic acids based on cationic polymeric submicron particles. AAPS J. 2004;6(1):10-21, ISSN 1550-7416. (IF2007: 3.756)
- MISCHIATI C, Finotti A, Sereni A, Boschetti S, Baraldi PG, Romagnoli R, Feriotto G, Jeang KT, Bianchi N, Borgatti M, Gambari R. Binding of hybrid molecules containing pyrrolo [2,1-c] [1,4] benzodiazepine (PBD) and oligopyrrole carriers to the human immunodeficiency type 1 virus TAR-RNA. Biochem Pharmacol. 2004 Feb 1;67(3):401-10, ISSN 0006-2952. (IF2007: 4.006)
- Tomassetti M, Feriotto G, Giacomini P, Giorda E, Bianchi N, Borgatti M, Finotti A, MISCHIATI C, Gambari R. Identification of a novel DNase I hypersensitive site within the far upstream region of the human HLA-DRA gene. Int J Mol Med. 2003 Dec;12(6):929-34, ISSN 1107-3756. (IF2007: 1.847)
- Borgatti M, Rutigliano C, Bianchi N, MISCHIATI C, Baraldi PG, Romagnoli R, Gambari R. Inhibition of NF-kB/DNA interactions and HIV-1 LTR directed transcription by hybrid molecules containing pyrrolo [2,1-c] [1,4] benzodiazepine (PBD) and oligopyrrole carriers. Drug Dev Res. 2003;60:173-85. ISSN 0272-4391. (IF2007: 0.976).
- Borgatti M, Romanelli A, Saviano M, Pedone C, Lampronti I, Breda L, Nastruzzi C, Bianchi N, MISCHIATI C, Gambari R. Resistance of decoy PNA-DNA chimeras to enzymatic degradation in cellular extracts and serum. Oncol Res 2003;13(5):279-87. ISSN 0965-0407. (IF2007: 1.347).
- MISCHIATI C, Puviani Ac, Brogli M, Guarniero S, Sereni A, Breda L, Ricci D, Galavotti D, Morsiani E, Gambari R. Modulation of pro-apoptotic (Bax) and anti-apoptotic (Bcl-2) gene expression in isolated porcine hepatocytes perfused within a radial-flow bioreactor after low-temperature storing. Int J Artif Organs. 2003 Feb;26(2):139-48, ISSN 0391-3988. (IF2007: 1.277)
- Borgatti M, Lampronti I, Romanelli A, Pedone C, Saviano M, Bianchi N, MISCHIATI C, Gambari R. Transcription factor decoy molecules based on a peptide nucleic acid (PNA)-DNA chimera mimicking Sp1 binding sites. J Biol Chem. 2003 Feb 28;278(9):7500-9, ISSN: 0021-9258. (IF2007: 5.581)
- Borgatti M, Breda L, Cortesi R, Nastruzzi C, Romanelli A, Saviano M, Bianchi N, MISCHIATI C, Pedone C, Gambari R. Cationic liposomes as delivery systems for double-stranded PNA-DNA chimeras exhibiting decoy activity against NF-kappaB transcription factors. Biochem Pharmacol. 2002 Aug 15;64(4):609-16, ISSN: 0006-2952. (IF2007: 4.006)
- MISCHIATI C, Borgatti M, Feriotto G, Rutigliano C, Breda L, Bianchi N, Gambari R. Inhibition of HIV-1 LTR-driven in vitro transcription by molecular hybrids based on peptide nucleic acids mimicking the NF-kappaB binding site. Int J Mol Med. 2002 Jun;9(6):633-9, ISSN: 1107-3756. (IF2007: 1.847)
- Feriotto G, Borgatti M, MISCHIATI C, Bianchi N, Gambari R. Biosensor technology and surface plasmon resonance for real-time detection of genetically modified Roundup Ready soybean gene sequences. J Agric Food Chem. 2002 Feb 27;50(5):955-62, ISSN: 0021-8561. (IF2007: 2.532)
- Romanelli A, Pedone C, Saviano M, Bianchi N, Borgatti M, MISCHIATI C, Gambari R. Molecular interactions with nuclear factor kappaB (NF-kappaB) transcription factors of a PNA-DNA chimera mimicking NF-kappaB binding sites. Eur J Biochem. 2001 Dec;268(23):6066-75. Convertito in FEBS Journal, ISSN 1742-464X. (IF2007: 3.396)
- Feriotto G, Corradini R, Sforza S, Bianchi N, MISCHIATI C, Marchelli R, Gambari R. Peptide nucleic acids and biosensor technology for real-time detection of the cystic fibrosis W1282X mutation by surface plasmon resonance. Lab Invest. 2001 Oct;81(10):1415-27, ISSN 0023-6837. (IF2007: 4.479)
- MISCHIATI C, Jeang KT, Feriotto G, Breda L, Borgatti M, Bianchi N, Gambari R. Aromatic polyamidines inhibiting the Tat-induced HIV-1 transcription recognize structured TAR-RNA. Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 2001 Aug;11(4):209-17, ISSN 1087-2906. (IF2000: 2.976) - NB: ultimo IF disponibile.
- Bianchi N, Chiarabelli C, Borgatti M, MISCHIATI C, Fibach E, Gambari R. Accumulation of gamma-globin mRNA and induction of erythroid differentiation after treatment of human leukaemic K562 cells with tallimustine. Brit J Haematol. 2001 Jun;113(4):951-61, ISSN: 0007-1048. (IF2007: 4.490)
- Feriotto G, Ferlini A, Ravani A, Calzolari E, MISCHIATI C, Bianchi N, Gambari R. Biosensor technology for real-time detection of the cystic fibrosis W1282X mutation in CFTR. Hum Mutat. 2001;18(1):70-81, ISSN 1059-7794. (IF2007: 6.273)
- Saviano M, Romanelli A, Bucci E, Pedone C, MISCHIATI C, Bianchi N, Feriotto G, Borgatti M, Gambari R. Computational procedures to explain the different biological activity of DNA/DNA, DNA/PNA and PNA/PNA hybrid molecules mimicking NF-kappaB binding sites. J Biomol Struct Dyn. 2000 Dec;18(3):353-62, ISSN 0739-1102. (IF2007: 1.413)
- Baraldi PG, Cacciari B, Guiotto A, Romagnoli R, Spalluto G, Leoni A, Bianchi N, Feriotto G, Rutigliano C, MISCHIATI C, Gambari R. 2,1-c 1,4 benzodiazepine (PBD)-distamycin hybrid inhibits DNA binding to transcription factor Sp1. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2000 Aug;19(8):1219-29, ISSN 1525-7770. (IF2007: 0.723)
- Manfredini S, Vicentini CB, Manfrini M, Bianchi N, Rutigliano C, MISCHIATI C, Gambari R. Pyrazolo-triazoles as light activable DNA cleaving agents. Bioorg Med Chem. 2000 Sep;8(9):2343-6, ISSN 0968-0896; (IF2007: 2.662)
- MISCHIATI C, Feriotto G, Borgatti M, Giacomini P, Gambari R. Characterization of a major histocompatibility complex class II X-box-binding protein enhancing tat-induced transcription directed by the human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat. J Virol. 2000 Oct;74(19):8989-9001, ISSN 0022-538X. (IF2007: 5.332)
- Nastruzzi C, Cortesi R, Esposito E, Gambari R, Borgatti M, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C. Liposomes as carriers for DNA-PNA hybrids. J Control Release. 2000 Aug 10;68(2):237-49, ISSN: 0168-3659. (IF2007: 4.756)
- Baraldi PG, Romagnoli R, Beria I, Cozzi P, Geroni C, Mongelli N, Bianchi N, MISCHIATI C, Gambari R. Synthesis and antitumor activity of new benzoheterocyclic derivatives of distamycin A. J Med Chem. 2000 Jul 13;43(14):2675-84, ISSN 0022-2623. (IF2007: 4.895)
- Baraldi PG, Romagnoli R, Duatti A, Bolzati C, Piffanelli A, Bianchi N, MISCHIATI C, Gambari R. Synthesis of hybrid distamycin-cysteine labeled with 99mTc: a model for a novel class of cancer imaging agents. Bioorg Med Chem Lett. 2000 Jun 19;10(12):1397-400, ISSN: 0960-894X. (IF2007: 2.604)
- Gambari R, Feriotto G, Rutigliano C, Bianchi N, MISCHIATI C. Biospecific interaction analysis (BIA) of low-molecular weight DNA-binding drugs. J Pharmacol Exp Ther. 2000 Jul;294(1):370-7, ISSN 0022-3565. (IF2007: 4.003)
- Bianchi N, Ongaro F, Chiarabelli C, Gualandi L, MISCHIATI C, Bergamini P, Gambari R. Induction of erythroid differentiation of human K562 cells by cisplatin analogs. Biochem Pharmacol. 2000 Jul 1;60(1):31-40, ISSN 0006-2952. (IF2007: 4.006)
- Baraldi PG, Balboni G, Cacciari B, Guiotto A, Manfredini S, Romagnoli R, Spalluto G, Thurston DE, Howard PW, Bianchi N, Rutigliano C, MISCHIATI C, Gambari R. Synthesis, in vitro antiproliferative activity, and DNA-binding properties of hybrid molecules containing pyrrolo [2,1-c] [1, 4] benzodiazepine and minor-groove-binding oligopyrrole carriers. J Med Chem. 1999 Dec 16;42(25):5131-41, ISSN 0022-2623. (IF2007: 4.895)
- Giuliani AL, Bigoni B, Veronesi M, Manservigi R, MISCHIATI C, Berti G, Zavagli G, Ricci G. Membrane protein pattern in hereditary spherocytosis in five subjects from north-east Italy obtained by SDS-PAGE using N,N'-diallyltartardiamide. Eur J Haematol. 1999 Nov;63(5):302-5, ISSN 0902-4441. (IF2007: 2.163)
- MISCHIATI C, Borgatti M, Bianchi N, Rutigliano C, Tomassetti M, Feriotto G, Gambari R. Interaction of the human NF-kappaB p52 transcription factor with DNA-PNA hybrids mimicking the NF-kappaB binding sites of the human immunodeficiency virus type 1 promoter. J Biol Chem. 1999 Nov 12;274(46):33114-22, ISSN 0021-9258. (IF2007: 5.581)
- MISCHIATI C, Pironi F, Milani D, Giacca M, Mirandola P, Capitani S, Zauli G. Extracellular HIV-1 Tat protein differentially activates the JNK and ERK/MAPK pathways in CD4 T cells. AIDS. 1999 Sep 10;13(13):1637-45, ISSN 0269-9370. (IF2007: 5.842)
- MISCHIATI C, Feriotto G, Bianchi N, Rutigliano C, Giacomini P, Gambari R. Analysis of the human HLA-DRA gene upstream region: evidence for a stem-loop array directed by nuclear factors. Biochimie. 1999 Mar;81(3):219-28, ISSN 0300-9084. (IF2007: 2.899)
- Feriotto G, Lucci M, Bianchi N, MISCHIATI C, Gambari R. Detection of the deltaF508 (F508del) mutation of the cystic fibrosis gene by surface plasmon resonance and biosensor technology. Hum Mutat. 1999;13(5):390-400, ISSN 1059-7794. (IF2007: 6.273)
- Bianchi N, Spalluto G, Cacciari B, Romagnoli R, Feriotto G, MISCHIATI C, Rutigliano C, Borsetti E, Baraldi PG, Gambari R. Selective binding to human genomic sequences of two synthetic analogues structurally related to U-71184 and adozelesin. Drug Dev Res 1999; 46:96-106, ISSN: 0272-4391. (IF2007: 0.976)
- Bianchi N, Osti F, Rutigliano C, Corradini FG, Borsetti E, Tomassetti M, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. The DNA-binding drugs mithramycin and chromomycin are powerful inducers of erythroid differentiation of human K562 cells. Br J Haematol. 1999 Feb;104(2):258-65, ISSN: 0007-1048. (IF2007: 4.490)
- Bertagnolo V, Neri Lm, Marchisio M, MISCHIATI C, Capitani S. Phosphoinositide 3-kinase activity is essential for all-trans-retinoic acid-induced granulocytic differentiation of HL-60 cells. Cancer Res. 1999 Feb 1;59(3):542-6, ISSN 0008-5472. (IF2007: 7.672)
- Milani D, Mazzoni M, Zauli G, MISCHIATI C, Gibellini D, Giacca M, Capitani S. HIV-1 Tat induces tyrosine phosphorylation of p125FAK and its association with phosphoinositide 3-kinase in PC12 cells. AIDS. 1998 Jul 30;12(11):1275-84, ISSN 0269-9370. (IF2007: 5.842)
- Rutigliano C, Bianchi N, Tomassetti M, Pippo L, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. Surface plasmon resonance for real-time monitoring of molecular interactions between a triple helix forming oligonucleotide and the Sp1 binding sites of human Ha-ras promoter: effects of the DNA-binding drug chromomycin. Int J Oncol. 1998 Feb;12(2):337-43, ISSN 1019-6439. (IF2007: 2.295)
- Bianchi N, Rutigliano C, Passadore M, Tomassetti M, Pippo L, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. Targeting of the HIV-1 long terminal repeat with chromomycin potentiates the inhibitory effects of a triplex-forming oligonucleotide on Sp1-DNA interactions and in vitro transcription. Biochem J. 1997 Sep 15;326 (Pt 3):919-27, ISSN 0264-6021. (IF2007: 4.009)
- Passadore M, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C, Rutigliano C, Gambari R. In vitro and in vivo binding of a CC-1065 analogue to human gene sequences: a polymerase-chain reaction study. Eur J Pharmacol. 1997 Jan 29;319(2-3):317-25, ISSN 0014-2999. (IF2007: 2.376)
- Bianchi N, Passadore M, Rutigliano C, Feriotto G, MISCHIATI C, Gambari R. Targeting of the Sp1 binding sites of HIV-1 long terminal repeat with chromomycin. Disruption of nuclear factor.DNA complexes and inhibition of in vitro transcription. Biochem Pharmacol. 1996 Nov 22;52(10):1489-98, ISSN 0006-2952. (IF2007: 4.006)
- Zauli G, Gibellini D, Celeghini C, MISCHIATI C, Bassini A, La Placa M, Capitani S. Pleiotropic effects of immobilized versus soluble recombinant HIV-1 Tat protein on CD3-mediated activation, induction of apoptosis, and HIV-1 long terminal repeat transactivation in purified CD4+ T lymphocytes. J Immunol. 1996 Sep 1;157(5):2216-24, ISSN 0022-1767. (IF2007: 6.068)
- Celeghini C, Marchisio M, MISCHIATI C, Bertolaso L, Capitani S, Zauli G. In vivo and in vitro modulatory effect of human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) Tat protein on protein kinase C activity. Int J Oncol. 1996; 8:349-54, ISSN 1019-6439. (IF2007: 2.295)
- Bianchi N, Passadore M, Feriotto G, MISCHIATI C, Gambari R, Piva R. Alteration of the expression of human estrogen receptor gene by distamycin. J Steroid Biochem Mol Biol. 1995 Sep;54(5-6):211-5, ISSN 0960-0760. (IF2007: 2.799)
- Feriotto G, MISCHIATI C, Bianchi N, Passadore M, Gambari R. Binding of distamycin and chromomycin to human immunodeficiency type 1 virus DNA: a non-radioactive automated footprinting study. Eur J Pharmacol. 1995 Jul 18;290(2):85-93, ISSN 0014-2999. (IF2007: 2.376)
- Passadore M, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C, Giacomini P, Piva R, Gambari R. Differential effects of distamycin analogues on amplification of human gene sequences by polymerase-chain reaction. Biochem J. 1995 Jun 1;308 ( Pt 2):513-9, ISSN 0264-6021. (IF2007: 4.009)
- Feriotto G, MISCHIATI C, Bianchi N, Rutigliano C, Giacomini P, Gambari R. Sequencing of an upstream region of the human HLA-DRA gene containing X' and Y' boxes. Nucleic Acids Res. 1995 May 25;23(10):1671-8, ISSN 0305-1048. (IF2007: 6.954)
- MISCHIATI C, Feriotto G, Fiorentino D, Gambari R. Chromatography in DNA radiolabeling: hands-off automation using a robotic workstation. J Chromatogr B Biomed Appl. 1995 Feb 17;664(2):303-10, ISSN 1570-0232. (IF2007: 2.935)
- MISCHIATI C, Feriotto G, Bianchi N, Gambari R. A non-radioactive automated protocol to study protein-DNA interactions by DNase I footprinting. Int J Oncol 1995; 6:153-6, ISSN 1019-6439. (IF2007: 2.295)
- Passadore M, Feriotto G, Bianchi N, Aguiari G, MISCHIATI C, Piva R, Gambari R. Polymerase-chain reaction as a tool for investigations on sequence-selectivity of DNA-drugs interactions. J Biochem Biophys Methods. 1994 Dec;29(3-4):307-19, ISSN 0165-022X. (IF2007: 1.338)
- Ciucci A, Feriotto G, MISCHIATI C, Gambari R, Animati F, Lombardi P, Natali PG, Arcamone F, Giacomini P. Distamycin analogues with improved sequence-specific DNA binding activities. Biochem Pharmacol. 1994 Oct 18;48(8):1583-91, ISSN 0006-2952. (IF2007: 4.006)
- Bianchi N, MISCHIATI C, Feriotto G, Fiorentino D, Di Biase S, Apicella N, Gambari R. Capillary electrophoresis: detection of hybridization between synthetic oligonucleotides and HIV-1 genomic DNA amplified by polymerase-chain reaction. J Virol Methods. 1994 May;47(3):321-9, ISSN 0166-0934. (IF2007: 1.933)
- Feriotto G, MISCHIATI C, Gambari R. Sequence-specific recognition of the HIV-1 long terminal repeat by distamycin: a DNAase I footprinting study. Biochem J. 1994 Apr 15;299 (Pt 2):451-8, ISSN 0305-1048. (IF2007: 6.954)
- Feriotto G, Ciucci A, MISCHIATI C, Animati F, Lombardi P, Giacomini P, Arcamone F, Gambari R. Binding of Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 to DNA: inhibition by distamycin and two novel distamycin analogues. Eur J Pharmacol. 1994 Apr 15;267(2):143-9, ISSN 0014-2999. (IF2007: 2.376)
- MISCHIATI C, Fiorentino D, Feriotto G, Bianchi N, Gambari R. A chromatographic procedure for fully automated isolation of DNA from human whole blood. J Biochem Biophys Methods. 1994 Apr;28(3):185-93, ISSN 0165-022X. (IF2007: 1.338)
- Bianchi N, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. Detection of hepatitis C virus by unbalanced polymerase-chain reaction, hybridization to synthetic oligonucleotides and capillary electrophoresis. Int J Oncol 1994; 4:903-7, ISSN 1019-6439. (IF2007: 2.295)
- Feriotto G, Pozzi L, Ciucci A, Camarda G, MISCHIATI C, D'Agnano I, Gambari R, Giacomini P. Methylation state of the human HLA-DRA gene in T-lymphocytes and B-lymphocytes of transgenic mice. Lack of methylation at one 5'-GCGC site is not required for gene expression. Eur J Biochem. 1993 Dec 1;218(2):485-92. Convertito in FEBS Journal, ISSN 1742-464X. (IF2007: 3.396)
- Bianchi N, MISCHIATI C, Feriotto G, Gambari R. Polymerase-chain reaction: analysis of DNA/DNA hybridization by capillary electrophoresis. Nucleic Acids Res. 1993 Jul 25;21(15):3595-6, ISSN 0305-1048. (IF2007: 6.954)
- MISCHIATI C, Fiorentino D, Feriotto G, Gambari R. Use of an automated laboratory workstation for isolation of genomic DNA suitable for PCR and allele-specific hybridization. Biotechniques. 1993 Jul;15(1):146-51, ISSN 0736-6205. (IF2007: 2.759)
- Feriotto G, Nastruzzi C, MISCHIATI C, Gambari R. N1-substituted tetra-benzamidines: inhibition of DNA-protein interactions and in vitro tumor cell growth. Int J Oncol 1992; 1:277-81, ISSN: 1019-6439. (IF2007: 2.295)
- Barbieri R, MISCHIATI C, Piva R, Nastruzzi C, Giacomini P, Natali PG, Gambari R. DNA methylation of the Ha-ras-1 oncogene in neoplastic cells. Anticancer Res. 1989 Nov-Dec;9(6):1787-91, ISSN 0250-7005. (IF2007: 1.414)
- Barbieri R, Gambari R, Buzzoni D, Piva R, Orlando P, MISCHIATI C, del Senno L, Nastruzzi C, Giacomini P, Natali PG. Methylation state of cellular genes and oncogenes as a marker of malignancy in human carcinomas. Tumori. 1989 Aug 31;75(4):321-8, ISSN 0300-8916. (IF2007: 0.597)


Capitoli di Libro

- MISCHIATI C, Sereni A, Khan MTH, Lampronti I, Gambari R. Effects of plant extracts on gene expression profiling: from macrorrays to microarray technology. In: Lead Molecules from Natural Products - Discovery and New Trends, collana Advances in Phytomedicine, volume 2, Mahmud TH Khan e Arjumand Ather editori, anno 2006, capitolo 2, pag. 21-34, Elsevier Science Publishing Company, PAESI BASSI, ISBN 978-0-444-51619-0
- Lampronti I, Khan MTH, Bianchi N, Feriotto G, MISCHIATI C, Borgatti M, Gambari R. Effects of Medicinal Plant Extracts on Molecular Interactions between DNA and Transcription Factors. In: Lead Molecules from Natural Products - Discovery and New Trends, serie Advances in Phytomedicine, volume 2, Mahmud TH Khan e Arjumand Ather editori, anno 2006, capitolo 3, pag. 35-44, Elsevier Science Publishing Company, PAESI BASSI, ISBN 978-0-444-51619-0


DESCRIZIONE DELL’ATTIVITÀ DI RICERCA

A. Impiego di tecnologie automatizzate basate su biostrumentazioni avanzate per lo sviluppo di analisi qualitative in medicina molecolare. Nell’ambito di queste ricerche sono stati messi a punto protocolli sperimentali innovativi che prevedono l’utilizzo di biostrumentazioni avanzate, come la stazione robotizzata Biomek per l’isolamento automatizzato di acidi nucleici, o il biosensore BIAcore (Pharmacia Biosensors) e l’elettroforesi capillare (Beckman) per lo sviluppo di metodiche di diagnostica molecolare utilizzabili per identificare in tempo reale di sequenze virali e di mutazioni geniche in campioni biologici. Nel campo dell’impiego dei biosensori SPR l’Università di Ferrara rappresenta un punto di riferimento in ambito nazionale.

B. Individuazione di marcatori molecolari a valenza prognostica in pazienti con melanoma ad alto rischio metastatico. In questo studio del trascrittoma è stato analizzato il profilo di espressione genico differenziale in melanociti e cellule di melanoma isolate dalla cute di pazienti affetti da melanoma aggressivo utilizzando la metodologia dei cDNA array. Nel 70% dei pazienti analizzati solo 23 geni venivano espressi in modo differenziale e in tutti soggetti la progressione tumorale correlava con una drastica riduzione dell’espressione dei geni STAT2, collageno di tipo VI e tetraspanina (CD9). Attraverso analisi RT-PCR quantitativa e immunoistochimica sono stati quindi analizzati i livelli di espressione di questi 3 geni in un’ampia casistica di nevi e melanomi metastatici, per verificare il loro possibile impiego diagnostico. I dati ottenuti hanno permesso di proporre l’analisi dell’espressione di questi specifici marcatori per l’identificazione precoce di pazienti affetti da melanoma con alto rischio di evoluzione in metastasi. La ricerca è stata condotta in collaborazione con il dott. Giacomini Patrizio, del Laboratorio di Immunologia dell’Istituto Regina Elena di Roma.

C. Analisi dell’espressione di geni indicatori della vitalità cellulare in un fegato bio-artificiale. La cura delle epatiti fulminanti rappresenta una sfida per la medicina moderna. In mancanza di un numero sufficiente di donatori di organi, il rimpiazzo delle funzioni vitali può essere ottenuto attraverso l'utilizzo di un fegato bio-artificiale (Bio-Artificial Liver, BAL) costituito da cellule di provenienza animale (al presente) od umana (nel futuro). Nell'ipotesi di utilizzo del BAL in procedure d'urgenza medica, poiché il suo allestimento richiede una procedura complessa che necessita di alcuni giorni, è necessario disporre di BAL pronti all'uso. Questa ricerca, condotta in stretta collaborazione con il dott. Enrico MORSIANI, ha permesso di conoscere l’arco temporale di attività detossificante del BAL e di determinare il tempo limite di conservazione prima dell’utilizzo. Per questi scopi è stata analizzata l’espressione di geni indicatori della vitalità cellulare (Bcl2 e Bax) e il potere detossificante, come indice della funzionalità epatica. I dati raccolti sostengono la possibilità di creare una banca di organi artificiali come presidio terapeutico da cui attingere in caso di necessità. Il BAL oggetto di studio è stato utilizzato in clinica ed ha permesso di salvare la vita ad un paziente di Modena in overdose di eroina.

D. Studio della regolazione dell’espressione del gene umano per il canale del sodio cardiaco al fine di ampliare le possibilità di diagnosi della malattie aritmiche. Questo progetto rappresenta una ricerca ancora agli albori, avviata nel 2006 in modo autonomo e svincolato dalla precedente unità di ricerca, condotta con fondi erogati dall’Università e dalla Fondazione CARIFE, di cui il dott. Mischiati è il responsabile scientifico. L’interesse sui meccanismi di fine regolazione della trascrizione del gene SCN5A è enorme in quanto esso è responsabile di malattie cardiache aritmiche a base genetica e subdole, la cui prima manifestazione spesso coincide con la morte improvvisa. Per queste patologie l’unico sistema di cura è la prevenzione e spesso non esistono indagini diagnostiche efficaci. Gli studi fin qui compiuti hanno evidenziato l’esistenza di più varianti trascrizionali del gene SCN5A e di nuovi promotori. Attraverso saggi di delezione unidirezionale del 5’ ed esperimenti di transfezione in cellule muscolari striate è stato possibile identificare un promotore minimale e regioni in grado di dirigere l’attività tessuto-specifica. L’analisi dell’espressione dei diversi trascritti SCN5A, differenti solo nella porzione 5’UTR e dovuti all’attività dei diversi promotori, ha rivelato pattern di espressione caratteristici in pazienti affetti da Brugada. Nel proseguo verranno cercate mutazioni nella regione del promotore in un’ampia casistica di pazienti affetti da patologie aritmiche, ma privi di mutazioni negli esoni del gene SCN5A, al fine di verificare l’esistenza di una correlazione tra patologia e presenza di specifiche mutazioni. In prospettiva, questi studi potrebbero permettere di estendere la possibilità di diagnosi della patologia.

E. Nuovi approcci metodologici nell’identificazione di OGM. In questo studio è stato utilizzato un biosensore per individuare in tempo reale la presenza di sequenze transgeniche in campioni di farine. Il metodo si basa sull’utilizzo di un DNA biotinilato, ottenuto dall'amplificazione del gene lectina della soia oppure dall'amplificazione del transgene Roundup Ready, che viene immobilizzato su di un sensorchip e che funge da esca per catturare prodotti PCR ottenuti dall’amplificazione dei medesimi geni nel campione di farina in esame. I risultati ottenuti hanno dimostrato che per mezzo di questo approccio metodologico è possibile riconoscere la presenza di sequenze transgeniche in modo certo, rapido e sensibile.

F. Effetto dei biomateriali derivati dall’idrossiapatite sull’espressione genica degli osteoblasti. La Biostite è un materiale derivato dall’idrossiapatite che viene normalmente impiegato dai dentisti nella ricostruzione dentaria. Utilizzando come modello sperimentale le linee osteoblastoidi MG-63 e SaOS-2, si è stato osservato che la Biostite riduce in modo significativo la proliferazione cellulare. L’analisi dei profili di espressione genica ha permesso di identificare 37 geni, coinvolti nei meccanismi di controllo della proliferazione, dell’interazione delle cellule con la matrice, del differenziamento degli osteoblasti e della rigenerazione del tessuto osseo, la cui espressione viene modificata da questo materiale di ricostruzione dentaria. Risultati ottenuti potrebbero spiegare il motivo di distacco del materiale di ricostruzione dalla superficie del dente. In particolare lo studio dell’espressione dei geni identificati in questa ricerca potrebbe essere impiegato nello sviluppo di nuovi materiali ricostruttivi/protesici.

G. Effetto di clorambucil, fludarabina e Nutlin-3 sulla progressione del ciclo cellulare e sull’induzione di apoptosi in linfociti B tumorali. I meccanismi di farmaco-resistenza nei tumori necessitano di una continua ricerca volta ad identificare nuovi agenti terapeutici. In questa ricerca è stata analizzata la risposta citotossica-citostatica di una linea linfoblastoide modello, la linea SKW6.4, a diversi composti come clorambucil, un farmaco alchilante, fludarabine, un’analogo delle purine, Nutlin-3, un attivatore non genotossico di p53, utilizzati da soli o in combinazione con TRAIL. L’esposizione a clorambucil, fludarabina, e Nutlin-3 induceva accumulo di p53 e modificazione della progressione del ciclo cellulare. In particolare il clorambucil determinava un accumulo nella fase G2/M, Nutlin-3 induceva un arresto precoce del ciclo cellulare in fase G1/S mentre la fludarabina evidenziava effetti intermedi. Per contro TRAIL da solo non modificava la progressione del ciclo cellulare ma induceva rapidamente apoptosi. L’analisi del profilo di espressione dei geni bersaglio di p53 ha evidenziato differenze in seguito al trattamento con clorambucil, fludarabina o Nutlin-3 che rispecchiano il differente effetto di questi composti sulla progressione cellulare. Va sottolineato che clorambucil, fludarabina e Nutlin-3 inducono l’aumento di espressione di TRAIL-R2. Come atteso, il pretrattamento delle cellule SKW6.4 con clorambucil, fludarabina e Nutlin-3 potenzia l’effetto apoptotico di TRAIL. Questa ricerca è stata condotta in collaborazione con il gruppo del Prof. Mauro Vaccarezza (Università di Cassino) e del dott. Celeghini Claudio (Università di Trieste).

H. Studio della regolazione del gene HLA-DRA. Lo studio dei meccanismi alla base della trascrizione dei geni MHC-II, ed in particolare le conoscenze sulla regolazione della trascrizione del gene umano HLA-DRA, all’inizio di questa ricerca erano frammentari. Gli elementi regolativi presenti nel promotore di questo gene non consentivano di giustificare tutti gli aspetti della sua regolazione trascrizionale, in particolar modo l’espressione tessuto-specifica. Gli studi svolti hanno cercato di colmare tale lacuna di conoscenza. Il sequenziamento di un’ampia porzione genomica in 5’ al gene HLA-DRA e l’analisi bioinformatica ha permesso di identificare una regione distante dal promotore classico che conteneva putativi siti di legame per fattori di trascrizione (TF). L’interazione di specifici TF con tali sequenze è stata dimostrata attraverso saggi di DNAse I footprinting ed EMSA. In seguito è stato possibile dimostrare la formazione di un struttura secondaria complessa che coinvolge l’intera regione del promotore nella quale i TF, anche se legati a elementi di sequenza lontani, vengono riallocati vicino al sito di inizio della trascrizione contribuendo alla modulazione dell’attività della RNA polimerasi II. L’impiego delle tecniche di ipersensibilità alla DNasi I e di topi transgenici, ha permesso rispettivamente di identificare un sito di ipersensibilità nella regione distale del promotore e di dimostrare che la nuova regione del promotore era necessaria per dirigere la trascrizione del transgene indotta dall’IFN- nei macrofagi. Ulteriori esperimenti hanno sottolineato l’importanza di un elemento NF-kB, presente nel promotore distale, nel potenziamento della trascrizione indotta dall’IFN-gamma.

I. Segnali intracellulari attivati dalla proteina Tat: studio degli effetti pleiotropici. La proteina Tat di HIV rappresenta un ottimo modello di studio biochimico in quanto esercita numerose funzioni biologiche ascrivibili ai diversi domini proteici. Pur essendo stata identificata come fattore di trascrizione virale, la presenza in essa di domini simili a quelli posseduti dalle integrine ha suggerito l’ipotesi che potesse agire da ligando su specifici recettori e scatenare cascate di trasduzione intracellulari. In questa ricerca sono state identificate alcune vie di trasduzione del segnale modificate in presenza di Tat extracellulare. Questo lavoro è stato condotto in collaborazione con il gruppo del Prof. Giacca Mauro (International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology, Trieste), del Prof. La Placa Michele (Università di Bologna, Istituto di Microbiologia) e del Prof. Zauli Giorgio (Università di Chieti, Istituto di Morfologia).

L. Studi biochimici e sviluppo molecolare di PNA di nuova generazione utili in terapia genica. Gli acidi nucleici peptidici (PNA) sono stabili nei fluidi biologici, caratteristica che li rende adatti per fini terapeutici. Gli studi effettuati in questa ricerca hanno cercato di chiarire se oligonucleotidi formati da PNA, contenenti sequenze riconosciute da specifici TF, potessero essere impiegati in terapia genica come molecole decoy. Questo possibile impiego è originale ed è stato proposto in prima mondiale dal nostro gruppo di ricerca. In un primo studio è stato chiarito che gli oligonucleotidi costituiti interamente da PNA possono legare specifici TF ma in modo instabile. È stato poi possibile dimostrare che l'instabilità del legame del TF con l’acido nucleico è ascrivibile alla diversa conformazione strutturale degli ibridi contenenti eliche a PNA e all’assenza dei gruppi fosfato con i quali poter formare legami addizionali. Partendo da questi presupposti sono state progettate molecole chimeriche, costituite da porzioni terminali a PNA e da porzioni interne a DNA, che avrebbero potuto potenziare l'effetto decoy dei PNA. I risultati ottenuti ha dimostrato che le chimere legano in modo stabile lo specifico TF, hanno una struttura tridimensionale simile al modello classico di Watson-Crick, mantengono la caratteristica resistenza alla degradazione nei fluidi biologici e possono essere facilmente veicolate nelle cellule attraverso microsfere e liposomi per modulare le specifiche funzioni. Queste ricerche hanno visto la collaborazione dei gruppi del Prof. Pedone Carlo (Università e CNR di Napoli, Centro Interuniversitario di Ricerca sui Peptidi Bioattivi e Centro di Ricerca sulla Biocristallografia, Napoli), del Prof. Nastruzzi Claudio (Università di Perugia) e della Prof. Cortesi Rita (Università di Ferrara, Dipartimento di Scienze Farmaceutiche).

M. Sviluppo di nuovi farmaci antivirali in grado di inibire la formazione del complesso Tat/TAR-RNA. L’interazione della proteina Tat con il TAR-RNA rappresenta la chiave di volta per l’innesco della replicazione del virus HIV. Molecole in grado di inibire questa interazione rappresentano potenziali farmaci antivirali. Diverse tipologie di composti ottenuti per sintesi chimica sono stati inizialmente sottoposti a saggio EMSA per valutarne il potenziale inibitorio dell’interazione Tat/TAR-RNA. Per quelli risultati attivi, è stata in seguito analizzata la capacità di inibire la trascrizione diretta dal promotore di HIV-1 in presenza della proteina Tat a) in un saggio “in vitro” e b) in un saggio ex-vivo nel quale sono state impiegate le cellule della linea HL3T1 come sistema modello in quanto contengono nel loro genoma il costrutto LTR-CAT. In questi studi è stato possibile identificare classi di molecole inibitorie che diffondono liberamente attraverso le membrane cellulari. Quest’ultime sono state analizzate per la capacità di inibire la proliferazione del virus HIV-1 in cellule CEM e per alcune molecole è stato possibile proporne il potenziale utilizzo come farmaci anti-HIV. Questa ricerca è stata effettuata in collaborazione con il Prof. Kuan Teh Jeang (Molecular Virology Laboratory, NIH, Bethesda, USA).

N. Modulatori del processo di trascrizione. Questa ricerca ha avuto come finalità la caratterizzazione biochimica di un numero rilevante di composti a basso peso molecolare in grado di legare il solco minore del DNA. Tra le molecole analizzate vanno ricordate la distamicina ed analoghi della distamicina, la cromomicina, CC-1065 ed analoghi, molecole ibride distamicina-antramicina, poliamidine aromatiche. Il meccanismo d’azione attraverso il quale queste molecole esplicano la loro attività biologica è stato saggiato mediate esperimenti di DNasi I footprinting, EMSA, arrested-PCR, trascrizione in vitro, PCR e analisi al biosensore.

O. Effetti molecolari dell’acido retinoico nelle cellule promielocitiche. Il modello di studio utilizzato è il differenziamento granulocitario delle cellule HL60 indotto dal trattamento con acido retinoico (RA). In questo modello gli esperimenti di Western blotting e di immunoprecipitazione hanno permesso di dimostrare che l’attivazione di PI3K rappresenta un evento precoce alla base dello stimolo differenziativi. In un altro modello, costituito da promielociti prelevati da pazienti affetti da leucemia mieloide acuta, è stato chiarito che Vav è un altro passo essenziale nel processo differenziativo. Successivamente, attraverso l’analisi del profilo di espressione genica in cellule in cui era stata inibita la fosforilazione Syk-dipendente delle tirosine di Vav, sono stati identificati geni responsivi all’azione di Vav. I risultati di questa ricerca, oltre a chiarire alcuni passaggi cruciali nel processo di maturazione delle cellule mieloidi, hanno permesso di identificare geni che potrebbero rappresentare un possibile bersaglio terapeutico per le patologie mieloproliferative. Questa ricerca è stata condotta in collaborazione con il gruppo del Prof. Capitani Silvano – Prof.ssa Bertagnolo Valeria (Università di Ferrara, Istituto di Anatomia, Laboratorio di Traduzione del Segnale)

P. Induzione dell’espressione di emoglobina fetale nell’adulto. La riespressione di emoglobina fetale nell’adulto beta-talassemico rappresenta un promettente approccio terapeutico. In questo studio sono ricercate molecole in grado di attivare la trascrizione dei geni della gamma-globina, valutandone l’attività in un sistema modello costituito dalle cellule K562 e dai precursori eritroidi isolati dal sangue di individui normali e beta-talassamici. Uno di questi composti , la rapamicina, è oggi in trial clinico per la terapia della beta-talassemia. Il suo utilizzo per queste finalità è stato oggetto di un brevetto internazionale del dott. Mischiati (PCT/IB2003/002632).