Curriculum

NOME E COGNOME: ANNALISA ASTOLFI

LUOGO E DATA DI NASCITA: Bologna, 08/12/1974

INDIRIZZO:    Dipartimento di Medicina Traslazionale e per la Romagna

Università degli Studi di Ferrara

Via Fossato di Mortara 70, 44121 Ferrara

Tel: +39 0532 455572

Email: annalisa.astolfi@unife.it

POSIZIONE ATTUALE: Ricercatore a tempo determinato lettera b) art.24, comma 3 Legge 240/2010

Settore Scientifico-Disciplinare BIO/17 Istologia - Settore concorsuale 05/H1

ABILITAZIONI SCIENTIFICHE NAZIONALI

Conseguimento dell’Abilitazione Scientifica Nazionale per la seconda fascia della docenza (Professore Associato) nei Settori concorsuali:

06/D3 Malattie del sangue, Oncologia e Reumatologia (dal 28/03/2018);

06/N1 Scienze delle professioni sanitarie e delle tecnologie mediche (dal 27/03/2018),

06/G1 Pediatria Generale, Specialistica e Neuropsichiatria infantile (dal 12/04/2018),

05/H2 Istologia (dal 24/9/2018);

05/E3 Biochimica Clinica e Biologia Molecolare Clinica (dal 5/10/2018).

06/A2 Patologia Generale e Patologia Clinica (dal 9/9/2019)

PROFILO SCIENTIFICO

ORCID ID: 0000-0002-2732-0747

SCOPUS Author ID: 7005785178

Researcher ID: K-3034-2016

ISTRUZIONE ED ESPERIENZE LAVORATIVE

Membro Collegio dei Docenti del Corso di Dottorato di Ricerca di Terapie Avanzate e Farmacologia Sperimentale - Università degli Studi di Ferrara.

Co-Supervisore nell’ambito del Dottorato di Ricerca di Oncologia, Ematologia e Patologia – Università degli Studi di Bologna, ciclo XXXIII (Progetto: “Sviluppo di modelli cellulari per l’individuazione di nuovi geni modificatori nella malattia di Gaucher”), ciclo XXXIV (Progetto: “Comprehensive characterization of SDH – GIST using NGS data and iPSC models”), ciclo XXXV (Progetto: “Sviluppo di modelli cellulari per lo studio di sarcoma a cellule chiare del rene dell’età pediatrica”). dal 28-01-2020

Ricercatore a Tempo Determinato di tipo b) in Istologia – Bio/17 presso Dipartimento di Scienze Biomediche e Chirurgico Specialistiche, Università di Ferrara. dal 01-12-2019 ad oggi

Incarico: Funzione specialistica a supporto della Didattica / Ricerca: “Specialista in sequenziamento massivo e microarray”. Affidata da Università di Bologna. dal 20-12-2016 ad oggi

Responsabile e Coordinatore del Laboratorio del Centro Interdipartimentale di Ricerche sul Cancro "Giorgio Prodi", Università di Bologna - Affidata da Università di Bologna. dal 24-10-2016 al 30-11-2019

Contratto a tempo indeterminato come tecnico di categoria D presso il Centro Interdipartimentale di Ricerche sul Cancro “Giorgio Prodi” dell’Università di Bologna. dal 01-12-2008 al 30-11-2019

Assegno di ricerca relativo al progetto: ”Identificazione del profilo  genetico e genomico di risposta ai farmaci convenzionali e innovativi  in bambini affetti da leucemia acuta” presso Dipartimento di Scienze Pediatriche  Mediche  e Chirurgiche dell’Universita’ di Bologna. dal 02-01-2007 al 30-11-2008

Contratto coordinato e continuativo con il Policlinico S. Orsola-Malpighi svolto presso il Laboratorio di Oncologia ed Ematologia Pediatrica “Lalla Seràgnoli” del Policlinico S. Orsola-Malpighi, Bologna. dal 01-01-2002 al 31-12-2004

Assegno di ricerca relativo al progetto: ”Analisi mediante microarray della progressione e prevenzione dei tumori” presso il Dipartimento di Patologia Sperimentale dell’Universita’ di Bologna. dal 01-01-2005 al 31-03-2005

Fellowship della Fondazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (FIRC) con progetto dal titolo “Immunoprevenzione del carcinoma mammario indotto da HER-2/neu”, presso il Dipartimento di Patologia Sperimentale dell’Universita’ di Bologna. dal 01-01-2002 al 31-12-2004

Dottore di Ricerca in Oncologia, Università di Bologna, con tesi dal titolo: “Citochine e fattori di crescita nei tumori muscolo-scheletrici: applicazioni di “gene discovery” e di terapia genica”, in data 06-03-2002

Borsa di studio di Dottorato in Oncologia, ciclo XIV, con il progetto: “Citochine e fattori di crescita nei tumori muscolo-scheletrici: applicazioni di “gene discovery” e di terapia genica”, presso il Dipartimento di Patologia Sperimentale dell’Universita’ di Bologna. dal 15-03-1999 al 31-12-2001

Abilitazione alla professione di Biologo, conseguita in data 07-09-2000

Laurea in Scienze Biologiche, 110/110 cum laude, Università di Bologna, con tesi dal titolo “Fattori di crescita e loro recettori in cellule di rabdomiosarcoma trasdotte con il gene della p53 normale”, in data 16-07-1998

ATTIVITÀ DI RICERCA SCIENTIFICA

Responsabile del progetto: "Hippo pathway targeting in uterine leiomyosarcoma” finanziato da Sarcoma Foundation of America, Washington DC, USA. dal 2021 ad oggi.

Responsabile del progetto: “Development of targeted treatments for BCOR-driven tumors” – finanziato da Università di Ferrara, Fondo per l’Incentivazione alla Ricerca” (FIR) – dal 2020 ad oggi.

CO-INVESTIGATOR nel progetto: "Studio dei meccanismi patogenetici e di approcci farmacologici alla malattia di Gaucher mediante induced Pluripotent Stem Cells” finanziato da Fondazione del Monte, Bologna. dal 2020 ad oggi.

CO-INVESTIGATOR nel progetto: “Identification of molecular targets in young GIST patients resistant to standard therapies”
finanziato da Fondazione Carisbo, Bologna. dal 2019 ad oggi.

CO-INVESTIGATOR nel progetto “Molecular and clinical study to improve the efficacy of adjuvant therapy in uterine leiomyosarcoma” finanziato da Fondazione S.Orsola, Bologna. dal 2019 ad oggi.

Responsabilità scientifica del progetto: “Sviluppo di modelli preclinici di malattia in ambito onco-ematologico pediatrico” - Affidata da Associazione Margherita Onlus. dal 27-02-2018 a 30-11-2019

CO-INVESTIGATOR nel progetto dell’Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC), sezione “My First AIRC” grant 2016, MFAG Id.19117, “Hedgehog pathway targeting in pediatric acute myeloid leukemia. dal 24-11-2016 ad oggi

Responsabile e Coordinatore del Laboratorio del Centro Interdipartimentale di Ricerche sul Cancro "Giorgio Prodi", Università di Bologna - Affidata da Università di Bologna. dal 24-10-2016 ad oggi

Responsabilità scientifica dello “Studio genomico dei Sarcomi a Cellule Chiare del Rene dell’età pediatrica”, presso Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche, Università di Bologna, in collaborazione con Prof. Spreafico e Dr.ssa Perotti – IRCCS Istituto Nazionale Tumori di Milano, AIEOP Gruppo di Lavoro sul Tumore di WILMS. dal 01-01-2015 ad oggi

Ricerca Finanziata da Illumina Inc. (San Diego, CA) per la messa a punto di un nuovo protocollo di exome enrichment. dal 24-04-2015 al 24-07-2015

PARTECIPAZIONE al progetto “Bando Giovani Ricercatori 2013 “Alessandro Liberati” del Programma di ricerca Regione-Università, “Whole transcriptome paired-end sequencing in pancreatic cancer and precursor lesions: from early detection to therapeutics implications”. dal 15-05-2014 al 31-12-2016

CO-INVESTIGATOR nel progetto in collaborazione con Prof. Eduardo Bruera, MD-Anderson Cancer Center, Houston TX e Accademia delle Scienze di Medicina Palliativa: “Protocol 2013-0193 - Genetic predictors of analgesic response to opioid therapy in outpatient palliative care patients with cancer pain”. dal 27-03-2014 ad oggi

INTERNAL COLLABORATOR nel progetto finanziato da Desmoid Tumor Research Foundation (DTRF) Grant Award 2013: “High throughput genome study to identify predictors of aggressiveness in patients with sporadic desmoid tumor who undergo a wait and see approach”. Collaborazione con IRCCS Istituto Nazionale Tumori di Milano. dal 28-01-2014 ad oggi

PARTECIPAZIONE al gruppo di ricerca Integrated Research Team (IRT) Alma Sequencing dell'Università di Bologna dedicato al tema del Next Generation Sequencing dei tumori solidi (http://www.irt.unibo.it/en/alma-sequencing). dal 10-01-2014 ad oggi

CO-INVESTIGATOR nel progetto dell’Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC), sezione “My First AIRC” grant 2013, MFAG Id.14327, “Whole-genome study of gastrointestinal stromal tumors (GISTs) resistant to tyrosine kinase inhibitors using NGS approach”. dal 02-01-2014 al 01-01-2017

PARTECIPAZIONE ai progetti di ricerca affidati dalla Fondazione Umberto Veronesi: “La via di segnalazione di Hedgehog come nuovo target terapeutico nelle leucemie acute mieloidi pediatriche a cariotipo normale” e “Sperimentazione preclinica di nuovi farmaci inibitori del pathway di Hedgeghog in cellule di leucemia acuta mieloide pediatrica a cattiva prognosi”. dal 01-01-2014 al 31-12-2015

CO-INVESTIGATOR nel progetto “Identification of cytogenetic and molecular subgroups of acute myeloid leukemias showing L-Asparaginase in vitro efficacy”, finanziato da EUSA-Pharma. dal 16-09-2013 al 16-09-2016

INTERNAL COLLABORATOR nel progetto “Programma di ricerca Regione-Università 2010-2012, “Innovative approaches to the diagnosis and pharmacogenetic-based therapies of primary hepatic tumours, peripheral B and T-cell lymphomas and lymphoblastic leukaemias” WP4: “Innovative clinical trials addressed by pharmacogenetic and pharmacogenomics approaches”. PI of the O.U: Prof. Andrea Pession. dal 17-06-2013 al 17-06-2016

PARTECIPAZIONE al progetto di collaborazione con Prof. Paolo Casali, Dr.ssa Silvia Stacchiotti, IRCCS Istituto Nazionale Tumori di Milano; Dr.ssa Roberta Maestro, CRO Aviano. “Studio osservazionale su campioni biologici di whole-trascriptome e whole-exome sequencing di comparazione fra condrosarcoma mixoide extrascheletrico e mioepitelioma maligno e dermatofibrosarcoma protuberans e dermatofibrosarcoma protuberans fibrosarcomatoso”. dal 15-04-2013 ad oggi

PARTECIPAZIONE al progetto di ricerca "Analisi di genomica dei tumori solidi rari (feocromocitoma/paraganglioma) mediante tecnologie “high-throughput” in collaborazione con Prof. Uberto Pagotto - U.O. Endocrinologia - Università di Bologna. dal 30-08-2013 ad oggi

PARTECIPAZIONE al progetto di ricerca affidato dalla Fondazione Umberto Veronesi, dal titolo: “Evoluzione clonale nella recidiva precoce della leucemia acuta mieloide dell’età pediatrica a cariotipo normale mediante il sequenziamento dell’esoma tramite next generation sequencing”. dal 01-07-2012 al 30-06-2013

PARTECIPAZIONE al progetto “Micro-RNA profiling in Gastrointestinal Stromal Tumors”, in collaborazione con FaBit, Dipartimento di Farmacia e Biotecnologie, Università di Bologna. Contributo Associazione Italiana GIST (AIG). dal 21-12-2012 ad oggi

CO-INVESTIGATOR nel progetto PRIN n° 2009FZZ4XM_004 bando 2009 all’interno della U.R. Prof. Minni, in collaborazione con i Dipartimenti di Scienze Mediche e Chirurgiche e di Medicina Specialistica, Diagnostica e Sperimentale, Università di Bologna e con Prof. Francesco Minni e Prof. Riccardo Casadei - U.O. Chirurgia Generale, Policlinico di S.Orsola, con progetto dal titolo: ”Analisi genomica integrata della risposta alla chemio-radioterapia neoadiuvante nel trattamento dell'adenocarcinoma pancreatico resecabile e localmente avanzato”. dal 01-12-2010 al 10-12-2013

CO-INVESTIGATOR al progetto “Analisi di genomica nei tumori stromali gastrointestinali (GIST) - Studio BIOGIST”, in collaborazione con Prof. Micheal Heinrich - Oregon Health and Science University, Portland, OR, USA; GISTSTUDYGROUP Bologna; Biocomputing Group, Università di Bologna; Dipartimento di Oncologia, Ospedale di Treviso. dal 30-10-2008 ad oggi

Membro del Gruppo di Lavoro multidisciplinare “GIST Study Group” di Bologna (www.giststudygroup.it), che conduce sperimentazioni cliniche internazionali che prevedono l'impiego di farmaci innovativi e programmi di ricerca preclinica mirati allo sviluppo di nuovi farmaci e di metodiche utili per la valutazione della loro efficacia. dal 01-01-2008 ad oggi

PARTECIPAZIONE scientifica agli studi prospettici monocentrici AllerGene “Studio sulla predisposizione genetica all’allergia in età pediatrica” e AllerGene2 “Studio sulla predisposizione genetica alla dermatite atopica in età pediatrica”, in collaborazione con U.O. Allergologia Pediatrica (Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche) e U.O Dermatologia – (Dipartimento di Medicina Specialistica Diagnostica e Sperimentale) - Policlinico S.Orsola-Malpighi, Università di Bologna. dal 16-07-2007 ad oggi

CO-INVESTIGATOR nel progetto finanziato da Fondazione del Monte di Bologna e Ravenna: “Studio sulla predisposizione genetica all’allergia in età pediatrica”, in collaborazione con U.O. Allergologia Pediatrica, Policlinico S.Orsola-Malpighi (Dipartimento di Scienze Mediche e Chirurgiche, Università di Bologna). dal 16-07-2007 al 15-07-2008

CO-INVESTIGATOR nel progetto Strategico di Ateneo 2006 "Analisi farmacogenetica e farmacogenomica degli inibitori delle Tirosin-Kinasi e loro applicazione in oncologia ed ematologia" per la caratterizzazione delle vie di segnalazione attive nelle T-ALL pediatriche, in collaborazione con il gruppo di ricerca del Prof. Alberto Maria Martelli (Dipartimento di Scienze Biomediche e Neuromotorie, Università di Bologna). Coordinatore: Prof. Stefano A. Pileri. U.R. Oncologia ed Ematologia Pediatrica - Prof. Andrea Pession. dal 20-05-2006 al 20-05-2008

COLLABORAZIONE con il gruppo di ricerca della Prof.ssa Alessandra Bordoni (Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari, Università di Bologna), per la caratterizzazione dell'effetto di n3-PUFA e fitosteroli su un modello di cardiomiociti. dal 01-01-2006 al 20-04-2011

CO-INVESTIGATOR nel progetto dell’Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC), sezione Investigator Grant 2006, IG Id.2517, “Novel therapy by inhibitors of histone deacetylases and methylases in MLL-related Acute Myeloid Leukemia”. PI: Prof. Andrea Pession. dal 01-01-2006 al 01-01-2008

PARTECIPAZIONE al progetto “Metastasi epatiche da cancro del colon-retto: fattori di rischio, prognosi e trattamento su basi molecolari”, Progetto PRIN del Ministero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca per l’anno 2005, in collaborazione con il gruppo di ricerca del Prof. Guido Biasco, Istituto di Ematologia ed Oncologia Medica, e con Prof. Ercolani, Transplantation Unit, Policlinico S.Orsola-Malpighi, Bologna. dal 06-04-2005 al 06-04-2007

Responsabilità del progetto: “Studio di fattibilità di installazione di una piattaforma Affymetrix per l’analisi di espressione genica dei tumori pediatrici” presso Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna - Policlinico S.Orsola-Malpighi, Unità Operativa di Pediatria, Oncologia ed Ematologia Pediatrica “Lalla Seragnoli”. dal 01-04-2005 al 31-12-2006

INTERNAL COLLABORATOR nel progetto finanziato dalla Fondazione Carisbo: “Studio del profilo di espressione genica dei tumori del bambino e dell’adulto”. dal 01-01-2005 al 01-01-2006

Responsabile del Progetto "Giovani Ricercatori" dell'Università di Bologna, presso U.C. Istituti di Cardiologia, Ematologia e Cancerologia, con progetto dal titolo: "Sviluppo e applicazioni di microarray nel rabdomiosarcoma”. dal 21-03-2000 al 21-03-2001

ORGANIZZAZIONE CONGRESSI SCIENTIFICI

ORGANIZZATORE in quanto membro della SEGRETERIA SCIENTIFICA del 5° Workshop “AIEOP in Lab”, nell’ambito delle attività del Gruppo di Lavoro AIEOP - Biologia Cellulare e Molecolare, Bologna, 28-29 Maggio 2018.

ORGANIZZATORE in quanto membro della SEGRETERIA SCIENTIFICA del Convegno “Cancro del pancreas: nuove sfide, nuove speranze?”, Policlinico S.Orsola-Malpighi, 31 Marzo 2017.

ORGANIZZATORE in quanto membro della SEGRETERIA SCIENTIFICA del Convegno “International symposium on: The Impact of Genomic Deep Sequencing on Paediatric Research and Clinical Practice”, Università di Bologna, 19-20 Novembre 2015.

ORGANIZZATORE in quanto membro della SEGRETERIA SCIENTIFICA del Convegno “New Drugs in Pediatric Oncology”, Bologna, 21-22 Marzo 2008.

ATTIVITA’ DIDATTICA

Titolare del corso di ISTOLOGIA - Corso Integrato di Anatomia e Istologia, Corso di Laurea in Biotecnologie Mediche, Università di Ferrara. da a.a. 2019/2020 a oggi.

Incarico di docenza al Master Universitario Internazionale di “Alta Formazione e Qualificazione in Cure Palliative” dell’Università di Bologna. Titolo: “Farmacogenomica". Febbraio 2014

Incarichi di docenza al Master Universitario “Medicina Palliativa: Modelli Organizzativi, Clinica, Ricerca, Leadership”, dell’Università di Bologna. Titolo: "La genetica molecolare nella malattia neoplastica e nella medicina palliativa” e “L'analisi del genoma e la potenziale applicabilità in cure palliative”. Gennaio 2010 - 2012

Incarico di docenza al Master Universitario “Organizzazione, Gestione e Assistenza in Hospice Residenziale e Hospice Domiciliare" dell’Università di Bologna. Titolo: “La genomica del dolore”. Febbraio 2009

Docente nel Modulo Didattico “Tecnologie dei microarrays” della durata di 23 ore (4 CFU), per la Laurea Specialistica di Biotecnologie Molecolari e Industriali, Università di Bologna, a.a. 2007-2008.

Docente Responsabile (Professore a contratto) del corso di “Tecnologie dei Microarray” (46 ore) per la Laurea Specialistica di Biotecnologie Molecolari e Industriali, Universita’ di Bologna, a.a. 2005-2006; a.a. 2006-2007

Tutorato per il corso di “Tecnologie dei Microarray” (30 ore) per la Laurea Specialistica di Biotecnologie Molecolari e Industriali, Universita’ di Bologna, a.a. 2004- 2005

Docente al corso: “Biology for dummies 2004”, Consorzio CINECA, Bologna. Talk: “Capire la patologia attraverso i profili di espressione genica”. Ottobre 2004

Docente al corso: “Scuola Nazionale di Biofisica 2004”, Bressanone. Titolo: “Capire la patologia attraverso i profili di espressione genica: prospettive e problemi dell’analisi con microarray”. Settembre 2004

CORRELATORE di tesi di laurea nei corsi di studio di: "Laurea Magistrale in Biologia della Salute”, “Laurea in Medicina e Chirurgia”, “Laurea in Biotecnologie Mediche”, "Laurea Magistrale in Biotecnologie Farmaceutiche", "Laurea Magistrale in Biodiversità ed Evoluzione", “Laurea in Scienze Biologiche”, Laurea Magistrale in Biologia Molecolare e Cellulare”, dal 2013 ad oggi.

PREMI E RICONOSCIMENTI

Affiliazione, in qualità di socio, alla società scientifica Associazione Italiana Ematologia ed Oncologia Pediatrica (AIEOP). dal 01-01-2017 ad oggi

Membro del Gruppo di Lavoro Nazionale "Biologia Molecolare e Cellulare" nell'ambito dell'Associazione Italiana di Ematologia ed Oncologia Pediatrica (AIEOP). dal 01-01-2017 al 31-12-2018

Partecipazione al progetto scientifico dal titolo: “Studio dei polimorfismi genetici non HLA-associati alla prognosi dei pazienti pediatrici sottoposti a trapianto da donatore non consanguineo”. Masetti R., Prete A., Rondelli R., Astolfi A., Urbini M., Libri V., Gasperini P., Pession A., vincitore del Premio nazionale dell’Associazione Italiana Donatori di Midollo Osseo, (ADMO), il 02-10-2010.

Premio dell’Associazione Ricercatori Nutrizione Alimenti (ARNA), Università di Bologna, per lo studio “EPA e DHA regolano geni implicati nell’ipertrofia e nello scompenso cardiaco” nell’ambito del I Congresso Nazionale ARNA, Bologna, il 23-03-2006

PUBBLICAZIONI PEER-REVIEWED su RIVISTE INTERNAZIONALI

1)     Autrice di 141 pubblicazioni su riviste internazionali dal 2000 al 2021

2)     Scopus h-index = 34

3)     Numero di citazioni totali (Scopus): 3576

ATTIVITÀ EDITORIALE, PUBBLICAZIONI WEB, CAPITOLI DI LIBRI

Ad hoc reviewer per le riviste Therapeutic Advances in Medical Oncology, Plos One, Oncotarget, Scientific Reports, Human Immunology, Molecular Oncology, Laboratory Investigation, Frontiers in Oncology, Cancers, Gastroenterology Research and Practice. (https://publons.com/researcher/1340048/annalisa-astolfi/peer-review). dal 01-01-2013 a oggi

Astolfi A. “New method enables analysis of preserved cancer specimens with exome sequencing” iCommunity Newsletter, Aprile 2015. (https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/icommunity/astolfi-nextera-rapid-capture-cancer-article-370-2015-001.pdf/)

Astolfi, A. e Croci, S. Terapia genica delle distrofie muscolari. In: Terapia Genica, a cura di P.-L. Lollini, C. De Giovanni, e P. Nanni, 1 ed, pp. 174-185. Bologna: Zanichelli, 2001.